Смысл второго реле(которое с черно\белым) ,защита от чего? 

Если на коробке есть надпись 2Slave  - в обоих. Если под крышкой доп.брелка есть буква "S" - он тоже метка.

По ссылке " примерно" что бы было понятно.))) Еще  http://autosiga.ru/elektroprovodka/hyundai/625-ustanovka-avtosignalizatsii-na-hyundai-accent-tochki-podklyucheniya-raspolozhenie-i-tsveta-provodov    И совсем хорошо тут http://autosiga.ru/ustanovochnye-karty/hyundai/74-hyundai-accent/100-ustanovka-avtosignalizatsii-starline-a91-dialog-na-hyundai-accent-2006-s-mkpp

Есть вариант купить чехол...))  Я на все системы чехлы одеваю,не только Е-серии. Целее будут брелки.

И реле и сигнализация должны "видеть" зажигание одновременно.

Надо выключить статус по КАН и подключить зажигание аналогом. 

На замке зажигания Вашего авто 5-6 проводов ,у силового разъема сигнализации 6 . В соответствие с инструкцией их надо подключить. Давайте сделаем проще ,Вы разберете подрулевой кожух и посмотрите что там и куда подулючено. А потом будем подсказывать ))  Вот тут можно посмотреть что и как(примерно) http://www.ultrastar.ru/6304/7465  должно быть

Все должно работать. Надо проверить подключение силовых проводов на замке зажигания.

Проверить питание на силовом модуле

Все отображения одинаковы. По поводу доп оборудования ,какое?