Потолочный таймер работать будет. Догреватель тоже.
Ест ньанс - если запустили дистанционно, пришли в машину, завели и поехали, в движение истекло время работы дистанционного запуска, тогда в режиме догревателя автоматически не включится, пока не заглушите и заново не заведете двигатель...

Altox запускает автономный(предпусковой в T6.1) по WBUS. Для этого нужно в кодирвании 18-го блока выключить дистанционное управление, чтобы LIN сменился на WBUS. 

Скорее всего M36 тоже будет запускать по WBUS.

Это касатеся только предпусковых. У догревателей запуск по WBUS заблокирован и нужно обновлять ПО отопителя.